Το Ελαφονήσι βρίσκεται κοντά στο νοτιοανατολικότερο σημείο της Κρήτης, 43 χιλιόμετρα από το Καστέλι και 76 από τα Χανιά.
Ο δρόμος από τη Χρυσοσκαλίτισσα συνεχίζει σα χωματόδρομος για το Ελαφονήσι, για το οποίο υπάρχουν οργανωμένες εκδρομές από το Καστέλι και τα Χανιά καθώς και καραβάκια από την Παλαιόχωρα. Διαθέτει υπέροχες παραλίες.